基于数据库挖掘CLEC16A基因在KIPAN中的表达及其临床意义
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教育部国家级大学生创新创业训练计划项目(202113287101)


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    [摘要]目的基于数据挖掘,研究CLEC16A基因与混合性肾癌(KIPAN)发展、预后的关系及意义。方法从TCGA数据库中下载KIPAN的CLEC16A基因表达谱及其临床信息,利用Perl脚本和R包进行处理并分析之间的关系。结果CLEC16A在KIPAN中的表达较正常组织低,且随着KIPAN临床分级的提高,CLEC16A的表达呈下调趋势。CLEC16A低表达与KIPAN预后不良呈正相关(总生存率:HR=0.69,P=0.006;无病生存率:HR=0.72,P=0.028)。基因富集分析结果显示,CLEC16A高表达主要在溶酶体和氧化磷酸化等生物学过程或通路存在富集。而CLEC16A低表达在抗原加工及呈递、免疫球蛋白A(IgA)肠道免疫网络产生、白细胞跨内皮迁移、NOD样受体信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等信号通路中存在富集。结论CLEC16A可能作为KIPAN发生的抑制物,其低表达是肾癌进展及不良预后的危险因素,高表达可能是抑制KIPAN发生的保护因子。

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引用本文

郭亚楠,陈佳雯,蒋奕斌,温珍珍,林泱泱,朱潘婵,钱晶.基于数据库挖掘CLEC16A基因在KIPAN中的表达及其临床意义[J].现代医药卫生,2022,38(18):3061-

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