目的探讨GZMB、SMARCD3在结核病和结节病中的差异性表达及其在二者鉴别诊断中的价值。方法在Gene Expression Omnibus数据库中下载结核病和结节病相关的数据集，采用生物信息技术分析找到结节病和结核病的差异表达基因，使用Venn在线软件选取在结核病和结节病中呈反向调节的基因，并使用数据集进行验证。选取2017年8月至2024年6月安徽医科大学第一附属医院、安徽医科大学第二附属医院、皖南医学院弋矶山医院病理科具有完整临床病理资料的46例结核病、35例结节病和24例其他肉芽肿性炎（19例异物肉芽肿，5例真菌肉芽肿）手术切除石蜡标本采用免疫组织化学（免疫组化）EnVision法检测其石蜡切片中GZMB、SMARCD3蛋白的表达，观察其在结核病和结节病中的差异表达，探讨其鉴别诊断结核病和结节病的价值。结果生物信息学分析：结核病GZMB、SMARCD3的表达与结节病比较，差异均有统计学意义（P<0.05）；GZMB在结节病中呈高表达，在结核病中呈相对低表达，鉴别诊断结核病和结节病的受试者工作特征曲线下面积（AUC）为0.731，SMARCD3在结核病中呈高表达，在结节病中呈相对低表达，鉴别诊断结核病和结节病的AUC为0.803，差异均有统计学意义（P<0.05）。临床病例免疫组化：结核病肉芽肿中GZMB、SMARCD3的表达与结节病肉芽肿比较，差异均有统计学意义（P<0.05）；GZMB预测结节病的AUC为0.800，SMARCD3预测结核病的AUC为0.778，二者联合检测辅助鉴别诊断结核病和结节病AUC为0.875，差异均有统计学意义（P<0.05）。结论GZMB在结节病中呈高表达，SMARCD3在结核病中呈高表达，二者可作为鉴别诊断结核病和结节病的潜在辅助指标，二者联合应用可提高鉴别诊断结核病和结节病的灵敏度和特异度。