目的探讨医学虚拟仿真系统在临床穿刺技能教学中的应用效果。方法选取该学院2021级和2022级临床医学专业本科生396名，根据是否使用线上医学虚拟仿真系统分为对照组（243名）和试验组（153名）。对照组采用传统的临床四大穿刺技能教学方式，试验组在对照组基础上使用医学虚拟仿真系统进行教学。比较2组各项穿刺技能考核成绩、合格率及各模块失分情况，同时分析穿刺技能考试成绩与医学虚拟仿真系统测试成绩及使用时长的相关性。结果试验组各项穿刺技能考核成绩及整体成绩均高于对照组，差异有统计学意义（P<0.05）。2组各项穿刺技能考核合格率及整体合格率比较，差异无统计学意义（P>0.05）。在操作前准备、患者体位、穿刺点定位、消毒铺巾、人文关怀、无菌观念模块中，2组整体项失分情况比较，差异有统计学意义（P<0.05）。在操作前准备、患者体位、穿刺点定位、消毒铺巾、麻醉、穿刺过程、人文关怀模块中，2组骨髓穿刺项失分情况比较，差异有统计学意义（P<0.05）。在操作后处理、消毒铺巾、标本收集、无菌观念模块中，2组腰椎穿刺项失分情况比较，差异有统计学意义（P<0.05）。在人文关怀、无菌观念模块中，2组胸腔穿刺项失分情况比较，差异有统计学意义（P<0.05）。各项穿刺技能考核成绩及整体成绩分别与医学虚拟仿真系统测试成绩及使用时长呈正相关（P<0.05）。结论使用医学虚拟仿真系统能有效提高临床医学专业本科生穿刺技能考核成绩，改善在各穿刺项中的失分情况，获得更好的教学效果。