目的探究不同时效重组人生长激素（rhGH）对矮小症儿童肠道菌群组成和丰富度的影响。方法选取2021年7月至2022年6月扬州大学附属苏北人民医院就诊初次使用rhGH治疗的32例3~<14岁矮小症儿童进行为期6个月的纵向随访。根据rhGH不同的时效性分为长效组（L组，n=16）和短效组（S组，n=16），L组使用聚乙二醇重组人生长激素（PEG-rhGH）注射液，S组使用rhGH注射液。收集rhGH治疗前、治疗3个月及6个月时的粪便样本进行高通量测序和生物信息分析，通过Anosim、LEfSe分析比较不同时效治疗期间儿童肠道菌群微生物群落的结构及丰富度差异。分析肠道菌群丰度与生长速率（GV）及胰岛素样生长因子-1（IGF-1）的相关性。结果最终收集粪便标本83例。重复测量方差分析结果表明，GV的时间效应、组间效应、交互效应差异均有统计学意义（F＝93.402，P＜0.001；F＝4.354，P=0.046；F＝5.593，P=0.011），而IGF-1只有时间效应具有统计学意义（F＝84.393，P＜0.001）。简单效应分析采用Bonferroni法对检验水准α＝0.05进行校正（α＝0.004）后，S组、L组的GV在治疗3个月［(0.78±0.27)、(0.78±0.29)cm/月］及治疗6个月［(0.83±0.18)、(1.11±0.26)cm/月］时均较治疗前［(0.29±0.06)、(0.26±0.03)cm/月］升高，差异均有统计学意义（P＜0.004）。S组GV在治疗3、6个月时比较，差异无统计学意义（P>0.004），而L组GV在治疗3、6个月时比较，差异有统计学意义（P＜0.004）。在治疗6个月时，S组GV与L组比较，差异有统计学意义（P＜0.004）。S组、L组的IGF-1水平在治疗3个月［(213.22±80.97)、(183.19±53.02)ng/mL］及治疗6个月［(346.46±78.86)、(354.97±115.40)ng/mL］时均较治疗前［(129.41±71.01)、(111.82±44.17)ng/mL］升高，且治疗6个月时的IGF-1水平较治疗3个月时升高，差异均有统计学意义（P＜0.004）。S组与L组不同随访阶段IGF-1水平比较，差异均无统计学意义（P>0.004）。Anosim分析结果显示，L组在治疗前、治疗3个月、治疗6个月任意时间儿童微生物群落结构比较，差异有统计学意义（R＝0.102，P=0.030；R＝0.176，P=0.025；R＝0.298，P=0.004）；S组在治疗3、6个月时分别与治疗前比较，差异有统计学意义（R＝0.170，P=0.004；R＝0.202，P=0.014）。物种差异分析结果显示，L组差异物种为治疗6个月时的肠球菌，S组差异物种为治疗前的疣微菌。相关性分析显示，IGF-1在L组与S组治疗6个月时均与拟杆菌门（属）丰度呈正相关（r＝0.637、0.577,P＜0.05），IGF-1在L组治疗3个月时与双歧杆菌属丰度呈正相关（r＝0.562,P＜0.05）。GV在S组治疗3个月时与放线菌门、变形菌门的丰度呈负相关（r＝－0.565、－0.500,P＜0.05），在L组治疗6个月时与变形菌门丰度呈负相关（r＝－0.702,P＜0.05）。结论rhGH可以通过调节肠道菌群的丰富度和多样性，增加有益菌的丰度，并且PEG-rhGH作用较rhGH明显。