【提要】当前临床医学专业学位研究生培养与住院医师规范化培训实行了并轨，临床医学专业学位研究生既要达到专业学位研究生培养的要求，同时也要完成住院医师规范化培训，其临床能力方面的培养得到了加强，但用于科研能力实践的时间减少，可能会削弱科研能力方面的培养。普通外科是外科学的基础学科，临床医学专业学位研究生的培养尤为重要。该文从4个方面探讨了如何改进并轨制下普通外科专业学位研究生科研能力的培养，包括增强意识，充分认识专业学位研究生科研能力培养的重要性；切实落实导师负责制，发挥导师指导科研的核心作用；加强在临床实践中融入科研思维能力的训练；优化课程体系，加强临床科研知识培训。