【提 要】 本科生导师制是目前我国高校普遍实施的一种旨在提高大学生人才素质的本科生教育管理制度，医科院校实施本科生导师制对培养医学本科生科研创新能力具有积极作用。该文就医科院校本科生导师制实施过程中出现的问题进行思考并提出相应的实施建议。充分发挥本科生导师制在创新人才培养中的积极作用需要进一步加强其制度建设并完善评价体系；实施过程中要兼顾医科院校本科生基础科研及临床科研创新能力的培养，并合理利用本科生导师制与其他创新活动的互补作用，全面培养本科生自主创新能力。