【摘 要】 目的 调查上海市高校附属医院科研项目基金管理的政策与环境，从文献计量学角度探讨科研论文成果与科研管理的关系，进一步探讨科研基金管理面临的问题和现状。 方法 采用文献计量学结合文献调查法、案例分析法，对2006~2010年被科学引文索引（SCI）收录的上海10所高校附属医院发表的科研论文进行定量和定性分析。 结果 上海市高校附属医院获得的科研基金来源多样，从整体看，多项基金共同合作参与发表成果的趋势越来越明显。大部分论文的被引频次都集中在1~10次，国家级、部级基金的论文质量总体高于其他来源。 结论 高水平高质量的论文需在持续的科研投入后，应逐步实现由量变到质变的突破。多项基金统筹结合，集中发展优势领域和重点学科，可以更高效地获得高质量的科研成果。科研基金投入增加，来源广泛对科研单位内部项目基金的内控和成本核算提出了更高的要求。在基金的统筹管理和监管的过程中，如何有效对投入的基金效率进行成果回报评估至关重要。