广东医学院科研基金面上项目(M2011022)
目的 对华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白(CsTMX)基因进行生物信息学分析。 方法 利用生物信息学方法(InterProScan、SignalP、TMHMM和SWISS-MODEL等相关软件)对CsTMX基因及相应氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、信号肽、亲水性/疏水性、三级结构进行预测分析。 结果 CsTMX基因的开放阅读框(ORF)包含414 bp,编码137个氨基酸,理论分子质量为16.04×103,等电点为5.16。TMHMM和SignalP3.0分析结果显示CsTMX含信号肽,其在第19~20位氨基酸之间有1个切割位点;InterProScan和SWISS-MODEL分析结果显示,TMX特征性结构域位于第21~27位氨基酸之间,并且具有高度保守的CPAC 基因序列。 结论 利用生物信息学知识和各种分析软件对CsTMX所编码的cDNA序列及理论蛋白质的理化性质、结构和功能域等进行预测和分析,能够为开展CsTMX的表达及其功能研究提供理论依据。
周晨慧,徐道华,汪肖云,陈文君,李 珊.华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白基因的生物信息学分析[J].现代医药卫生,2015,31(7):969-