新肺癌相关基因hERGIC3的克隆与生物信息学分析
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基金项目:贵州省科学技术基金(黔科合J字[2013]2319号),遵义医学院博士启动基金(F-655)支助。


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    【摘 要】 目的 构建hERGIC3基因的原核表达载体,并对其进行生物信息学分析,以期全面地了解hERGIC3蛋白的生物学功能。 方法 采用实时半定量聚合酶链反应(RT-PCR)方法获取人类hERGIC3基因的开放阅读框(ORF)框DNA序列插入pGEM-T Easy载体;选择多个软件对hERGIC3蛋白进行生物信息学分析。 结果 酶切结果显示,插入序列为目标序列,成功克隆了hERGIC3基因;生物信息学分析结果显示:hERGIC3蛋白由383个氨基酸残基组成,相对分子质量为43.2×103,理论等电点为5.68,蛋白比较稳定;hERGIC3为跨膜蛋白,跨膜区为20~42和345~367,膜外区域为1~19和368~383,膜内区域为43~344;二级结构含有110个α螺旋、94条延伸链、184个随机卷曲、15个潜在的磷酸化位点,hERGIC3可能参与了氨基酸、辅酶的生物合成以及脂肪、能量代谢和蛋白质翻译、转运等功能;hERGIC3含有ERGIC_N和COPⅡcoated_ERV 2个蛋白保守结构域,hERGIC3可能与PPKCSH、ERGIC1、ERGIC2、COPA、PSMD11等蛋白有相互作用。 结论 成功克隆了hERGIC3 基因;深入地分析了hERGIC3的结构与功能,为下一步研究hERGIC3基因在肺癌中的病理生理功能奠定了理论基础。

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引用本文

耿娜娜,吴明松*, 郑 翔,刘兴宇,李学英.新肺癌相关基因hERGIC3的克隆与生物信息学分析[J].现代医药卫生,2014,30(16):2404-

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