目的 运用地理信息系统（GIS）的理论和方法分析中国87个人群常染色体D3S1358、vWA基因座的空间群体遗传结构，为研究中华民族的起源、人口迁移、考古以及民族融合等群体遗传学和人类学问题提供分子生物学依据。 方法 应用主成分分析（PCA）方法及GIS中的空间差值分析（SDA）技术，从基因频率矩阵中提取综合指标，并采取可视化技术来反映中国人群2个短串联重复序列（STR）位点的空间群体遗传结构。 结果 中国人群D3S1358、vWA基因座的主成分空间分析结果划分出三大区域，且显示出从东南向西北递增的趋势，在每个区域内又有不同划分小区域。 结论 中国人群2个 STR位点的空间群体遗传结构呈现明显的地理遗传梯度变异性，不同群体之间存在明显差异。